Prévalence, étude de la sensibilité aux antibiotiques et typage des souches animales et humaines de Campylobacter thermotolérants isolées dans l'Est de l'Algérie

Abstract

La présente étude a porté sur 1200 échantillons, dont 960 échantillons aviaires et 240 échantillons humains. Cette étude a pour objectifs ; l’évaluation de la prévalence des Campylobacter thermotolérants chez le poulet de chair et chez l’Homme dans l’Est de l’Algérie, la caractérisation phénotypique des souches isolées au moyen de galeries Api Campy et de test d’agglutination au latex (Dryspot Campylobacter), l’étude de leur sensibilité aux antibiotiques, et en fin l’étude de l’effet de certains facteurs de risque sur le taux de contamination aussi bien chez l’Homme que chez la volaille. Pour les échantillons aviaires, selon la norme NF-ISO 10272/2006, l’étude a porté sur 480 échantillons fécaux, 240 cæca et 240 échantillons de peaux de cou. Alors que, pour les échantillons humains, l’étude a porté sur 120 écouvillons rectaux et 120 prélèvements de selles diarrhéiques. Les Campylobacter thermotolérants ont été isolés à partir de 65%, 55% et 70% du total des échantillons fécaux, de peaux de cou et de cæca respectivement. Au niveau des élevages, il existe une recrudescence saisonnière des infections à Campylobacter durant la période estivale (p<0.05). En revanche, la taille du troupeau, l’âge des sujets ne semblent pas avoir un effet sur le taux de contamination. Les souches isolées appartenaient à quatre espèces, l’espèce la plus fréquente C. jejuni (73.5%) suivie par C. coli (24 %), C. lari (1.6%) et C. upsaliensis (0.8%). L’étude de la sensibilité aux antibiotique a montré que toutes les souches étaient résistantes à l’ampicilline et à l’amoxicilline / ac. Clavulanique, (83.3%) à l’érythromycine, (66,3%) à la tétracycline, (46,7%) à la ciprofloxacine. En revanche, aucune résistance n’a été constatée pour la gentamicine. L’étude du profil de résistance nous a permis d’établir 16 profils de résistance différents. Le plus commun a été constaté 127 fois, incluant cinque antibiotiques. De plus, elle a révélé que 99.7% des souches présentaient une multirésistance aux antibiotiques. 37,6% des souches isolées présentaient des profils critiques associant une résistance à la ciprofloxacine et à l’érythromycine à la fois. La présence de Campylobacter thermotolérants a été mise en évidence dans 36 échantillons humains, soit un taux d’isolement de 15%. Les patients âgés moins 5 ans sont plus exposés à l’infection. La campylobactériose humaine présente une recrudescence saisonnière avec un pic durant la saison chaude estivo- automnale. En revanche, L’infection n'était pas influencée par le sexe du patient. Des résistances acquises aux antibiotiques se sont développées, sauf à la gentamicine et le chloramphénicol. Si la résistance à l’érythromycine est restée faible (5.5%), il est important de surveiller la résistance à la ciprofloxacine qui est en augmentation (41.7%). Les souches humaines isolées appartenaient à trois espèces, l’espèce la plus fréquente C. jejuni (75%) suivie par C. coli (16.7 %) et C. upsaliensis (8.3%). La technique de prélèvement n’a pas une grande influence sur le taux d’isolement chez les volailles. Alors que chez les êtres humains, il semble que l’écouvillonnage rectal donne un taux d’isolement plus élevé que celui obtenu à partir des selles diarrhéiques. D’autre part, nous avons trouvé que le milieu de Karmali (à base de charbon) et Preston (à base de sang) présentaient des taux de récupération et de sélectivité similaires.